在治疗前采集血清样本,治疗后随访,根据临床预后指标进行分组。检测血清代谢谱,筛选差异特征峰,分析差异代谢分子含量变化,分析差异代谢通路的富集情况。
基于差异代谢分子构建不同分组的机器学习判别模型,进行交叉验证、外部验证等,绘制ROC曲线,评估模型诊断效能。还可进一步进行前瞻性临床试验,将血清代谢组学预测结果与真实临床结局对比。
将差异代谢物和脂质映射到基因或蛋白上,然后进行差异基因生存分析。挑选感兴趣的目的基因深入研究,进行基因集富集分析(GSEA)、细胞或动物水平机制和功能验证等。